Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DTX3Q8N9I9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DTX3Q8N9I9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms