Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDCL2Q8N4E4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDCL2Q8N4E4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274 ms