Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSRB3Q8IXL7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MSRB3Q8IXL7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms