Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELFCDQ8IXH7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELFCDQ8IXH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms