Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC22A9Q8IVM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC22A9Q8IVM8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC22A9Q8IVM8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms