Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC9A9Q8IVB4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9A9Q8IVB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9A9Q8IVB4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9A9Q8IVB4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9A9Q8IVB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms