Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC25Q86WR0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC25Q86WR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC25Q86WR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms