Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLNKQ7Z7G1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLNKQ7Z7G1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLNKQ7Z7G1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms