Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT25Q7Z3Z0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT25Q7Z3Z0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT25Q7Z3Z0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT25Q7Z3Z0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms