Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
APTXQ7Z2E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APTXQ7Z2E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APTXQ7Z2E3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms