Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNC2Q6ZN30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BNC2Q6ZN30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BNC2Q6ZN30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms