Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CD109Q6YHK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CD109Q6YHK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CD109Q6YHK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
CD109Q6YHK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CD109Q6YHK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms