Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD2Q6Y1H2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD2Q6Y1H2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HACD2Q6Y1H2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms