Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP12Q6UXS9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP12Q6UXS9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP12Q6UXS9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP12Q6UXS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms