Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBLN3Q6UW01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CBLN3Q6UW01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBLN3Q6UW01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBLN3Q6UW01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms