Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CASC1Q6TDU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CASC1Q6TDU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CASC1Q6TDU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CASC1Q6TDU7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms