Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZBED9Q6R2W3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZBED9Q6R2W3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZBED9Q6R2W3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZBED9Q6R2W3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms