Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC8BQ6P9F7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC8BQ6P9F7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8BQ6P9F7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms