Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHLDB3Q6NSJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHLDB3Q6NSJ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHLDB3Q6NSJ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHLDB3Q6NSJ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms