Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCTP1Q6DN14 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCTP1Q6DN14 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCTP1Q6DN14 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCTP1Q6DN14 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms