Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUPD1Q68J44 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUPD1Q68J44 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUPD1Q68J44 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DUPD1Q68J44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms