Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPCAT4Q643R3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LPCAT4Q643R3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPCAT4Q643R3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LPCAT4Q643R3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms