Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf135Q5VTT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf135Q5VTT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms