Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP58Q5T655 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP58Q5T655 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP58Q5T655 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP58Q5T655 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms