Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TREML2Q5T2D2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TREML2Q5T2D2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TREML2Q5T2D2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TREML2Q5T2D2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms