Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAPCD1Q5SSQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms