Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EFHC1Q5JVL4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EFHC1Q5JVL4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EFHC1Q5JVL4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EFHC1Q5JVL4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms