Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q56UQ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q56UQ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q56UQ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q56UQ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q56UQ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q56UQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q56UQ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q56UQ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q56UQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q56UQ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q56UQ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q56UQ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q56UQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q56UQ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q56UQ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q56UQ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q56UQ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q56UQ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms