Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BOLA3Q53S33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BOLA3Q53S33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA3Q53S33 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms