Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC58Q4VC31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC58Q4VC31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC58Q4VC31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms