Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
UVSSAQ2YD98 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
UVSSAQ2YD98 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UVSSAQ2YD98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UVSSAQ2YD98 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms