Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VMACQ2NL98 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VMACQ2NL98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms