Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
STX1AQ16623 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
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STX1AQ16623 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STX1AQ16623 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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