Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1AQ15573 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1AQ15573 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1AQ15573 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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