Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BRD3Q15059 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRD3Q15059 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRD3Q15059 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms