Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RFTN1Q14699 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFTN1Q14699 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFTN1Q14699 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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