Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1DQ13901 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1DQ13901 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1DQ13901 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1DQ13901 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1DQ13901 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1DQ13901 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1DQ13901 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1DQ13901 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1DQ13901 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1DQ13901 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1DQ13901 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1DQ13901 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1DQ13901 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1DQ13901 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1DQ13901 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1DQ13901 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1DQ13901 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1DQ13901 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1DQ13901 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1DQ13901 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1DQ13901 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1DQ13901 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1DQ13901 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1DQ13901 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1DQ13901 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1DQ13901 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1DQ13901 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1DQ13901 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1DQ13901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1DQ13901 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1DQ13901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1DQ13901 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1DQ13901 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1DQ13901 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1DQ13901 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1DQ13901 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1DQ13901 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1DQ13901 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1DQ13901 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1DQ13901 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1DQ13901 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1DQ13901 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1DQ13901 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1DQ13901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1DQ13901 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1DQ13901 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1DQ13901 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1DQ13901 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1DQ13901 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1DQ13901 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1DQ13901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1DQ13901 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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