Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTMR3Q13615 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTMR3Q13615 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTMR3Q13615 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTMR3Q13615 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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