Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP140Q13342 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SP140Q13342 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SP140Q13342 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SP140Q13342 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP140Q13342 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140Q13342 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140Q13342 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140Q13342 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140Q13342 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140Q13342 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140Q13342 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140Q13342 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140Q13342 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140Q13342 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140Q13342 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140Q13342 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140Q13342 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140Q13342 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140Q13342 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140Q13342 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140Q13342 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140Q13342 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140Q13342 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140Q13342 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SP140Q13342 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SP140Q13342 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140Q13342 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140Q13342 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140Q13342 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140Q13342 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140Q13342 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP140Q13342 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP140Q13342 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP140Q13342 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SP140Q13342 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140Q13342 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140Q13342 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140Q13342 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140Q13342 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140Q13342 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140Q13342 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140Q13342 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140Q13342 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140Q13342 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140Q13342 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140Q13342 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP140Q13342 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP140Q13342 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP140Q13342 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140Q13342 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140Q13342 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140Q13342 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140Q13342 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140Q13342 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
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