Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 SPHK1-209ENST00000591762 2502 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-7■■■□□ 18.3
SRSF9Q13242 SPHK1-208ENST00000591651 541 ntTSL 412.84□□□□□ -0.351e-7■■■□□ 18.3
SRSF9Q13242 SPHK1-205ENST00000588682 858 ntTSL 311.67□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 18.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-210ENST00000487899 669 ntTSL 36.91□□□□□ -1.34e-6■■■□□ 18.3
SRSF9Q13242 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.334e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 210.46□□□□□ -0.734e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 59.97□□□□□ -0.814e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 59.84□□□□□ -0.834e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 29.54□□□□□ -0.884e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 29.33□□□□□ -0.924e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 39.28□□□□□ -0.924e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-206ENST00000420747 685 ntTSL 36.31□□□□□ -1.43e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-207ENST00000421427 804 ntTSL 36.09□□□□□ -1.433e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 25.26□□□□□ -1.573e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.63e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-209ENST00000437725 545 ntTSL 44.21□□□□□ -1.743e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.743e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-210ENST00000453013 733 ntTSL 24.11□□□□□ -1.753e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.893e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 TFPI-205ENST00000417013 554 ntTSL 22.91□□□□□ -1.943e-7■■■□□ 18.2
SRSF9Q13242 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-14■■■□□ 18
SRSF9Q13242 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 25.98□□□□□ -1.453e-14■■■□□ 18
SRSF9Q13242 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 STX16-NPEPL1-201ENST00000413559 557 ntTSL 35.63□□□□□ -1.512e-6■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RNF31-203ENST00000491351 1804 ntTSL 516.54■□□□□ 0.245e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.155e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 ERRFI1-205ENST00000487559 787 ntTSL 214.1□□□□□ -0.155e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.165e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 TRIM65-202ENST00000540128 886 ntTSL 313.6□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.315e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.565e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RNF31-209ENST00000559071 1943 ntTSL 211.03□□□□□ -0.645e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RNF31-224ENST00000560787 2834 ntTSL 29.55□□□□□ -0.885e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 AL136295.5-201ENST00000558468 4798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.145e-10■■■□□ 17.9
SRSF9Q13242 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 512.54□□□□□ -0.43e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■□□ 17.8
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SRSF9Q13242 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.853e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.963e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 AP1G2-225ENST00000556743 1456 ntTSL 1 (best)9.88□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 AP1G2-206ENST00000553629 1301 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 AP1G2-227ENST00000556943 747 ntTSL 36.99□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 17.8
SRSF9Q13242 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■■■□□ 17.7
SRSF9Q13242 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.887e-7■■■□□ 17.7
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SRSF9Q13242 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.47□□□□□ -0.573e-6■■■□□ 17.6
SRSF9Q13242 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■□□ 17.6
SRSF9Q13242 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.153e-6■■■□□ 17.6
SRSF9Q13242 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.337e-7■■■□□ 17.6
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SRSF9Q13242 PNN-206ENST00000557680 912 ntTSL 33.82□□□□□ -1.85e-11■■■□□ 17.5
SRSF9Q13242 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-13■■■□□ 17.5
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SRSF9Q13242 PROC-205ENST00000427769 598 ntTSL 48.1□□□□□ -1.116e-17■■■□□ 17.5
SRSF9Q13242 PROC-210ENST00000474030 501 ntTSL 46.72□□□□□ -1.336e-17■■■□□ 17.5
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SRSF9Q13242 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 17.4
SRSF9Q13242 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.68□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 17.4
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SRSF9Q13242 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 217.08■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 312.1□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 511.35□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 39.09□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-6■■■□□ 17.2
SRSF9Q13242 BPTF-208ENST00000544778 7573 ntTSL 517.9■□□□□ 0.464e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.44e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.24e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 BPTF-203ENST00000335221 2627 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.264e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.654e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.684e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.744e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.884e-9■■■□□ 17.1
SRSF9Q13242 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 17
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 210.57□□□□□ -0.721e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-207ENST00000482359 604 ntTSL 510.18□□□□□ -0.781e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.011e-9■■■□□ 16.9
SRSF9Q13242 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 16.8
SRSF9Q13242 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC8.62□□□□□ -1.035e-22■■■□□ 16.8
SRSF9Q13242 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.655e-22■■■□□ 16.8
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