Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBX3Q13185 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBX3Q13185 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX3Q13185 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CBX3Q13185 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBX3Q13185 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CBX3Q13185 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBX3Q13185 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBX3Q13185 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CBX3Q13185 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX3Q13185 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX3Q13185 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX3Q13185 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX3Q13185 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX3Q13185 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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