Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRPL28Q13084 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MRPL28Q13084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL28Q13084 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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