Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YMR155WYMR155W 1644 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 PRI2YKL045W 1587 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 MDM31YHR194W 1740 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 TOK1YJL093C 2076 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 RKI1YOR095C 777 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 UBC11YOR339C 471 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1B-GR3Q12316 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt9.4□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 SFC1YJR095W 969 nt9.4□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 HBN1YCL026C-B 582 nt9.4□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 FBA1YKL060C 1080 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 MRPL36YBR122C 534 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YJR015WYJR015W 1533 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 SQT1YIR012W 1296 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 MIA40YKL195W 1212 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 GCN3YKR026C 918 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YLL066CYLL066C 3618 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YLL067CYLL067C 3618 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 AIM2YAL049C 741 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YPT1YFL038C 621 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 TMT1YER175C 900 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YKL031WYKL031W 414 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 PEX31YGR004W 1389 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 TOD6YBL054W 1578 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 CDC34YDR054C 888 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 RRP4YHR069C 1080 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YPR114WYPR114W 948 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YDL114WYDL114W 927 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 AIM24YJR080C 1185 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 POP5YAL033W 522 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 RGT2YDL138W 2292 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 YOR012WYOR012W 414 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 CAR1YPL111W 1002 nt9.34□□□□□ -0.91
TY1B-GR3Q12316 MCH1YDL054C 1461 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 HAP3YBL021C 435 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 IES2YNL215W 963 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 TOS6YNL300W 309 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 RAD24YER173W 1980 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 CNE1YAL058W 1509 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 HSM3YBR272C 1443 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YEL068CYEL068C 333 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 TSA1YML028W 591 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 ALD5YER073W 1563 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 SEC24YIL109C 2781 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 TKL2YBR117C 2046 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 MIP1YOR330C 3765 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YFL064CYFL064C 525 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 CCP1YKR066C 1086 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YLR123CYLR123C 330 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YPR202WYPR202W 717 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YDR415CYDR415C 1125 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 NUD1YOR373W 2556 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 GAA1YLR088W 1845 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 UTR2YEL040W 1404 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt9.27□□□□□ -0.92
TY1B-GR3Q12316 PRB1YEL060C 1908 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 PMA2YPL036W 2844 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 MCM3YEL032W 2916 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YIR042CYIR042C 711 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 PEX13YLR191W 1161 nt9.27□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 MLC1YGL106W 450 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 ATG33YLR356W 594 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 ICT1YLR099C 1185 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 SPE4YLR146C 903 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 SOG2YOR353C 2376 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YPL062WYPL062W 405 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YJR107WYJR107W 987 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 MRPS16YPL013C 366 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YJL225CYJL225C 5277 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 NPP1YCR026C 2229 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 HXK1YFR053C 1458 nt9.23□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YNR042WYNR042W 429 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YCL041CYCL041C 495 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1B-GR3Q12316 SEC20YDR498C 1152 nt9.21□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 YER137CYER137C 447 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 RPS9AYPL081W 594 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 YGR182CYGR182C 354 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 LDS1YAL018C 978 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 MTC1YJL123C 1437 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 ATG4YNL223W 1485 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 BDF2YDL070W 1917 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 RFC1YOR217W 2586 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 PAN6YIL145C 930 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 HDA1YNL021W 2121 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 APE3YBR286W 1614 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 RPL21AYBR191W 483 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 PRC1YMR297W 1599 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 AMD1YML035C 2433 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 ARC35YNR035C 1029 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 WHI2YOR043W 1461 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt9.15□□□□□ -0.94
TY1B-GR3Q12316 YNR014WYNR014W 639 nt9.15□□□□□ -0.94
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