Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 GLN1YPR035W 1113 nt5.97□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 DOT1YDR440W 1749 nt5.96□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 SSK22YCR073C 3996 nt5.96□□□□□ -1.45
MSH5Q12175 EMW1YNL313C 2715 nt5.96□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YLR296WYLR296W 327 nt5.96□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YNL017CYNL017C 339 nt5.96□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 GSY2YLR258W 2118 nt5.96□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 MCH1YDL054C 1461 nt5.96□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 PYC2YBR218C 3543 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 RRP46YGR095C 672 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 LCB3YJL134W 1230 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 SWD1YAR003W 1281 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 MSS1YMR023C 1581 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YPL257WYPL257W 582 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 DBP9YLR276C 1785 nt5.95□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YPQ1YOL092W 927 nt5.94□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 CPA1YOR303W 1236 nt5.94□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 LDB16YCL005W 771 nt5.94□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 ICP55YER078C 1536 nt5.94□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 CHO1YER026C 831 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YGL235WYGL235W 537 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 PUP1YOR157C 786 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 MRP51YPL118W 1035 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 RIM101YHL027W 1878 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 SUB2YDL084W 1341 nt5.93□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 APE4YHR113W 1473 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 TRP3YKL211C 1455 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 SPG1YGR236C 288 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YLR358CYLR358C 564 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 IFA38YBR159W 1044 nt5.92□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 TBF1YPL128C 1689 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 DUG1YFR044C 1446 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 JIP4YDR475C 2631 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 VMA3YEL027W 483 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 PDA1YER178W 1263 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 POP5YAL033W 522 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YLL056CYLL056C 897 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 RPL10YLR075W 666 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 POR1YNL055C 852 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 MRPL19YNL185C 477 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YOL131WYOL131W 327 nt5.91□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 IRS4YKR019C 1848 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 GDA1YEL042W 1557 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 GUA1YMR217W 1578 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 MDE1YJR024C 735 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 NPA3YJR072C 1158 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 FUS3YBL016W 1062 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 IDP3YNL009W 1263 nt5.9□□□□□ -1.46
MSH5Q12175 HIR1YBL008W 2523 nt5.9□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 MSC3YLR219W 2187 nt5.9□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 NTE1YML059C 5040 nt5.9□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 TMT1YER175C 900 nt5.89□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 TRR2YHR106W 1029 nt5.89□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 GEP5YLR091W 882 nt5.89□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 DAP1YPL170W 459 nt5.89□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YCL049CYCL049C 939 nt5.89□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 IMA2YOL157C 1770 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 PDR18YNR070W 4002 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 TEL2YGR099W 2067 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 FAL1YDR021W 1200 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 LYS1YIR034C 1122 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YML079WYML079W 606 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YPL067CYPL067C 597 nt5.88□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 ROG3YFR022W 2202 nt5.87□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.87□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 snR30snR30 606 nt5.87□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 GAT1YFL021W 1533 nt5.87□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 CHS5YLR330W 2016 nt5.87□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 SNU71YGR013W 1863 nt5.86□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 GAA1YLR088W 1845 nt5.86□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YLL067CYLL067C 3618 nt5.86□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 SPS22YCL048W 1392 nt5.85□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 MAK32YCR019W 1092 nt5.85□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 CWC27YPL064C 906 nt5.85□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 TKL1YPR074C 2043 nt5.85□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YFL052WYFL052W 1398 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 RPT3YDR394W 1287 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 YIA6YIL006W 1122 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 MEH1YKR007W 555 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 RUF23RUF23 254 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 PFA3YNL326C 1011 nt5.84□□□□□ -1.47
MSH5Q12175 VTC2YFL004W 2487 nt5.84□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 CST6YIL036W 1764 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 CRZ1YNL027W 2037 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 PRS4YBL068W 981 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YMC1YPR058W 924 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 BUD9YGR041W 1644 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 CMR1YDL156W 1569 nt5.83□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 NUP49YGL172W 1419 nt5.82□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 ASN1YPR145W 1719 nt5.82□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 UME1YPL139C 1383 nt5.82□□□□□ -1.48
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