Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 TPK1YJL164C 1194 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 DID2YKR035W-A 615 nt6.41□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 VMA3YEL027W 483 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 CUP2YGL166W 678 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 TFG2YGR005C 1203 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 SPG1YGR236C 288 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 RFC4YOL094C 972 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 TAE1YBR261C 699 nt6.4□□□□□ -1.38
SMF3Q12078 UIP5YKR044W 1332 nt6.4□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 BNA5YLR231C 1362 nt6.4□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YGL072CYGL072C 360 nt6.39□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YMR122CYMR122C 375 nt6.39□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 CTF19YPL018W 1110 nt6.39□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 RRP9YPR137W 1722 nt6.39□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 SOH1YGL127C 384 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 TDH2YJR009C 999 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YJR146WYJR146W 354 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YLR463CYLR463C 552 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 VMA2YBR127C 1554 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 MIP1YOR330C 3765 nt6.38□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 SIT1YEL065W 1887 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 DDC1YPL194W 1839 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 ZWF1YNL241C 1518 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 NOG2YNR053C 1461 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 VPS72YDR485C 2388 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 FAL1YDR021W 1200 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 FYV1YDR024W 486 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 TRP5YGL026C 2124 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 LYS1YIR034C 1122 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YML018CYML018C 1182 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 MSO1YNR049C 633 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 YPL257WYPL257W 582 nt6.36□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 IES1YFL013C 2079 nt6.35□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 VMS1YDR049W 1899 nt6.35□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 DYS1YHR068W 1164 nt6.35□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 SEC18YBR080C 2277 nt6.35□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 EDE1YBL047C 4146 nt6.35□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 PEX31YGR004W 1389 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 MSP1YGR028W 1089 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 MPC2YHR162W 390 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 MIA40YKL195W 1212 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 OGG1YML060W 1131 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 SGF29YCL010C 780 nt6.34□□□□□ -1.39
SMF3Q12078 ARE2YNR019W 1929 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YMR279CYMR279C 1623 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 HEM2YGL040C 1029 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YUR1YJL139C 1287 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 GCN3YKR026C 918 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 SRL2YLR082C 1179 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 AIM33YML087C 939 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 RUF23RUF23 254 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YNL200CYNL200C 741 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 PTC3YBL056W 1407 nt6.33□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YMR295CYMR295C 594 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 KSH1YNL024C-A 219 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 ADH5YBR145W 1056 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YGR054WYGR054W 1929 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 AVT4YNL101W 2142 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 ISC1YER019W 1434 nt6.32□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YNL120CYNL120C 486 nt6.31□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 TOS6YNL300W 309 nt6.31□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 HEM1YDR232W 1647 nt6.3□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YDR415CYDR415C 1125 nt6.3□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 JJJ3YJR097W 519 nt6.3□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 FSF1YOR271C 984 nt6.3□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 PTC4YBR125C 1182 nt6.3□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YMR155WYMR155W 1644 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YPT1YFL038C 621 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 MDE1YJR024C 735 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YJR107WYJR107W 987 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 YPR196WYPR196W 1413 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 CEF1YMR213W 1773 nt6.29□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 PCS60YBR222C 1632 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 MSS116YDR194C 1995 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 DUG1YFR044C 1446 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 GTO3YMR251W 1101 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 SCS7YMR272C 1155 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 RNH201YNL072W 924 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 ARO10YDR380W 1908 nt6.28□□□□□ -1.4
SMF3Q12078 MRPL10YNL284C 969 nt6.27□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 YPR204WYPR204W 3099 nt6.27□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 YDR387CYDR387C 1668 nt6.26□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 VPS24YKL041W 675 nt6.26□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 LDB16YCL005W 771 nt6.26□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 SES1YDR023W 1389 nt6.26□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 ARG81YML099C 2643 nt6.26□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 UTP9YHR196W 1728 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 PRY3YJL078C 2646 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 SDH4YDR178W 546 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 FBA1YKL060C 1080 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 YKR032WYKR032W 315 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 FPR3YML074C 1236 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 AIM17YHL021C 1398 nt6.25□□□□□ -1.41
SMF3Q12078 MSY1YPL097W 1479 nt6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms