Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ST3GAL1Q11201 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ST3GAL1Q11201 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ST3GAL1Q11201 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ST3GAL1Q11201 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ST3GAL1Q11201 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ST3GAL1Q11201 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ST3GAL1Q11201 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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