Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RASGEF1BQ0VAM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RASGEF1BQ0VAM2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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