Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RIPPLY1Q0D2K3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms