Protein–RNA interactions for Protein: Q04377

LCD1, DNA damage checkpoint protein LCD1, yeastyeast

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCD1Q04377 MRPL35YDR322W 1104 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 YJR146WYJR146W 354 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 DID2YKR035W-A 615 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 DRE2YKR071C 1047 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 YNR048WYNR048W 1182 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 YPR076WYPR076W 375 nt7.4□□□□□ -1.22
LCD1Q04377 IMG1YCR046C 510 nt7.39□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 TIF2YJL138C 1188 nt7.39□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.39□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 TIF1YKR059W 1188 nt7.39□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 SWD1YAR003W 1281 nt7.39□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 NUP49YGL172W 1419 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 RBS1YDL189W 1374 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 TRP1YDR007W 675 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 VPS61YDR136C 573 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 AIM24YJR080C 1185 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 OGG1YML060W 1131 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YNL092WYNL092W 1203 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 COQ3YOL096C 939 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 DSE3YOR264W 1293 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 FIT2YOR382W 462 nt7.38□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 COX10YPL172C 1389 nt7.37□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 PPM1YDR435C 987 nt7.37□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YEL074WYEL074W 339 nt7.37□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 RKI1YOR095C 777 nt7.37□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 CDC16YKL022C 2523 nt7.37□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 PPH21YDL134C 1110 nt7.36□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 DMA1YHR115C 1251 nt7.36□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YHC3YJL059W 1227 nt7.36□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 PGM1YKL127W 1713 nt7.35□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 SMC5YOL034W 3282 nt7.35□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 PEX3YDR329C 1326 nt7.35□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 snR78snR78 87 nt7.35□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 BUD9YGR041W 1644 nt7.34□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 PFK2YMR205C 2880 nt7.34□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.34□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YML6YML025C 861 nt7.34□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 YBL112CYBL112C 318 nt7.34□□□□□ -1.23
LCD1Q04377 SHO1YER118C 1104 nt7.33□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.33□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 URE2YNL229C 1065 nt7.33□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 ENP1YBR247C 1452 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YDR401WYDR401W 564 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 ERP5YHR110W 639 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 LYS12YIL094C 1116 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 COA1YIL157C 594 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 BSC4YNL269W 396 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YOL079WYOL079W 399 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YPL257WYPL257W 582 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 ASR1YPR093C 867 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YBR226CYBR226C 411 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 ILV6YCL009C 930 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 FMP40YPL222W 2067 nt7.32□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 GPD2YOL059W 1323 nt7.31□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 HXT2YMR011W 1626 nt7.31□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YKL077WYKL077W 1179 nt7.31□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YNL017CYNL017C 339 nt7.31□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 PET20YPL159C 762 nt7.31□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 COX9YDL067C 180 nt7.3□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 LCL3YGL085W 825 nt7.3□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 QCR8YJL166W 285 nt7.3□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 CTR1YPR124W 1221 nt7.3□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 RGD1YBR260C 2001 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 MRPL1YDR116C 858 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 ICT1YLR099C 1185 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YNL234WYNL234W 1281 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 MRPL23YOR150W 492 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YIL055CYIL055C 1884 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 DPB2YPR175W 2070 nt7.29□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 SVF1YDR346C 1446 nt7.28□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 IRC7YFR055W 1023 nt7.28□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 MED6YHR058C 888 nt7.28□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 RSA3YLR221C 663 nt7.28□□□□□ -1.24
LCD1Q04377 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YLR463CYLR463C 552 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YMR252CYMR252C 405 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 MRPS18YNL306W 654 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 SAL1YNL083W 1485 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 DAL7YIR031C 1665 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 SKI2YLR398C 3864 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YML133CYML133C 4125 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 PRP2YNR011C 2631 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 STB5YHR178W 2232 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 CRH1YGR189C 1524 nt7.27□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YBR138CYBR138C 1575 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YDR514CYDR514C 1452 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 RRP46YGR095C 672 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 YIR042CYIR042C 711 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 LDB16YCL005W 771 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 CSC1YLR241W 2349 nt7.26□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 ARO10YDR380W 1908 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 FAL1YDR021W 1200 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 RAI1YGL246C 1164 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 ASF1YJL115W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 IES2YNL215W 963 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 MRPL36YBR122C 534 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 ADE17YMR120C 1779 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 HRQ1YDR291W 3234 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 KEL1YHR158C 3495 nt7.25□□□□□ -1.25
LCD1Q04377 APM4YOL062C 1476 nt7.24□□□□□ -1.25
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