Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TOP2BQ02880 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
TOP2BQ02880 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
TOP2BQ02880 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
TOP2BQ02880 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms